La Junta Directiva tiene como función ejecutar las decisiones tomadas en la asamblea general de iComunales, que es dónde reside la soberanía de la organización. Los cargos de presidencia, vicepresidencia y tesorería son ostentados por comunales, mientras que los vocales pueden ser también personas del mundo académico, ONG u otros perfiles que la asamblea considere de interés